Achei nesse forum gringo um cara com o mesmo problema que eu
Já mexi em tudo aqui, revirei tudo e não tem jeito do hlds ler o arquivo, na verdade ele le o arquivo pois quando starto ele, aparece o seguinte no console:
couldn't exec listip.cfg
couldn't exec banned.cfg
Ou seja, ele não tá reconhecendo esses arquivos, mas está lendo o server.cfg, porém não altera hostname, mp_freezetime, nada "/